Top.Mail.Ru
Тюменский государственный медицинский университет

Размер шрифта:

  • A
  • A
  • A

Цветовая схема:

  • A
  • A
  • A
Тюменский государственный медицинский университет

Лаборатория геномики, протеомики, метаболомики

  • О подразделении
  • Сотрудники
  • Документы
  • Контакты

Лаборатория «Геномики, протеомики и метаболомики»:
  • Выделение и хранение ДНК
  • Фармогенетические исследования
  • Исследования по определению предрасположенности к наследственным мульти факториальным заболеваниям различными методами: ПЦР-ПДРФ, ПЦР в реальном времени, секвенирование по Сэнгеру
  • Разработка и внедрение методов диагностики десинхроноза на биохимическом уровне
  • Поиск молекулярно-генетических причин заболеваний с наследственной этиологией
  • Разработка и внедрение молекулярно-генетических методов диагностики наследственных, мульти факториальных заболеваний
  • Биохимические исследования (определение уровня гормонов в плазме крови, определение концентраций низкомолекулярных соединений в биологических жидкостях организма)

Направления исследований: 
  1. Анализ молекулярных путей адаптации организма человека и использование неинвазивных методов для повышения качества жизни населения Арктики. Лаборатория занимается поиском биомаркеров, позволяющих оценить уровень адаптации человека в условиях Арктики (вахтовых работников, военнослужащих и т.п.). Комбинирование методов темометри, актиметрии, геномики, протеомного анализа  и биохимического анализа позволяет использовать получаемые экспериментальные данные для создания диагностических систем нового поколения для скрининга и профилактики хронических неинфекционных заболеваний детей и взрослых.
  2. Проведение исследований в рамках проекта «Внедрение антропоцентрического освещения в домах и на рабочих местах жителей Арктики и субарктики для улучшения здоровья, сна и работоспособности «Свет Арктики» («LightArctic»).
Оборудование:

Наименование Функции прибора  Технические характеристики 
Устройство секвенирования ДНК "Нанофор" 

11.JPG

Генетический анализатор Нанофор-05 – первый 8-капиллярный секвенатор (секвенирование по сэнгеру) российского производства. Основные приложения прибора – секвенирование de novo и ресеквенирование, фрагментный анализ: микросателлитный анализ, LOH, AFLP, исследование однонуклеотидных полиморфизмов (snp).


Применение:

Идентификация микроорганизмов, секвенирование плазмид для проверки правильности введения ДНК в вектор, проверка вариантов, обнаруженных с помощью NGS, подтверждение редактирования генома, проверка подлинности клеточных линий, генотипирование snp, mlpa, анализ микросателлитных маркеров.


Идентификация микроорганизмов, секвенирование плазмид для проверки правильности введения днк в вектор, проверка вариантов, обнаруженных с помощью ngs, подтверждение редактирования генома, проверка подлинности клеточных линий, генотипирование snp, mlpa, анализ микросателлитных маркеров. 

Количество капилляров: 8                                                                                                                    Напряжение, проводие к капилляром: 0,5 ÷ 20 (±0,03%) кВ
Чувствительность анализа: 10 клеток исходного образца
Точность фрагментного анализа: ±1/ до 700 (точность в ±нуклеотид / длина фрагмента в нуклеотидах)
Точность секвенирования: 700 / >98 (длина фрагмента в нулеотидах / точность в %)
Скорость анализа (длина фрагмента в нуклеотидах / время): 700/1,5 часа
Сопряжение с компьютеров: Интерфейс USB
Автоматическая замена геля: Да
Автоматическое нанесение образца: Да
Возможность работы без оператора, при полной автоматизации: Да
Детектор: Флуорометрический для приема сигналов с максимумами флуоресценции 520, 550, 580, 610, 650 нм
Чувствительность по флуоросцеину: до 10ˉ11 М
Лазер: Твердотельный, λ= 488 нм, мозность Р = 20 мВт
Потребляемая мощность в рабочем режиме, не более: 300 ВА
Масса без запасных частей и принадлежностей, не более: 55 кг
Габариты: 610* 625* 682 

Термоциклер для амплификации нуклеиновых кислот HK1000 в комплекте с модулем реакционным оптическим C1000 Touch Thermal Cycler 

12.jpg

Амплификатор в реальном времени CFX96 touch с термоблоком 96 х 0.2 мл: 6 каналов детекции, температурный градиент, FRET, сенсорный дисплей, анализ кривых плавления HRM. Уровни экспрессии генов различаются на разных этапах заболевания и могут служить прогностическими маркерами тяжести болезни.


Уровни экспрессии генов, таких как:

• главный регулятор клеточного роста и пролиферации MTOR (mammalian target of rapamycin);

• маркер аутофагии ulk1; ингибитора циклинзависимых киназ р21;

• индикатор апоптозной активности каспазы 3;

• провоспалительный цитокин фактора некроза опухоли α (TNFα) в крови больных ревматоидным артритом

• генотипирование полиморфных вариантов генов, ассоциированных с разными патологиями.

Термоциклер: C1000 Touch™
Входная мощность, Вт, не более: 850
Частота, Гц, одна фаза: 50–60
Цветной дисплей высокого разрешения, см: 12 х 9
Порты (USB A / USB B): 5/1
Предохранители — 2 (А/В/мм): 10/250/20
Встроенная память, протоколы: >1000
Размеры, см (дюймы): 33 х 46 х 20/13 х 18 х 8
Вес, кг/фунт: 23.10.
Режимы контроля температуры: Рассчет и блокировка
ПЦР лицензия: да
Функции безопасности (защита паролем, необязательный вход в систему и безопасный режим): да
Отчетность (экспортируемые журналы запусков и журналы системных ошибок): да
Встроенное программное обеспечение, Windows CE 6.0: да
Совместимость с ПК (Windows XP или выше): да
Совместимость с периферийными устройствами USB (мышь, флэш-накопитель USB, считыватель штрих-кода): да
Обновление ПЦР в реальном времени: да
Мгновенная инкубация: да 
Система гель-документирования ChemiDoc XRS+ System 
13.jpg

Chemidoc XRS+ − многофункциональная система гель-документирования для работы с широким спектром образцов. Программное обеспечение image lab позволяет решать основные задачи анализа и документирования гелей и мембран, и быстро получать точные и воспроизводимые результаты. Для фиксации нечетких, расплывчатых и бледных полос в систему chemidoc XRS+ встроена система охлаждения.


Решаемые задачи:


• Анализ одномерных и двумерных гелей

• Колориметрический анализ вестерн- и дот-блотов

• Флуоресценция

• Детекция хемилюминесценции

• Детекция нуклеиновых кислот

• Денситометрия

• Работа с гелями stain-free по безокрасочной технологии 
Операционная система: Windows XP SP3 Professional 32-bit Windows Vista SP2 Ultimate
32-bit Windows 7 Professional
Mac OS X 10.5 or 10.6
Процессор: Core 2 Duo 2.09 GHz или выше
Пространство на жестком диске: >100 ГБ (минимум 20 ГБ)
Системная память: >1024 МБ
Разрешение экрана: 1280 x 1024 или выш
Порты для подсоединения инструментов: 1 свободный SB 2.0 порт
Другой software: Microsoft Office 2000 or later (Windows)
Office 2008 или iWork (Mac) 
Система для СВЧ-обеззараживания медицинских отходов УОМО-01/150-"О-ЦЕНТ" 
14.jpg

Cистема для СВЧ-обезвреживания  медицинских отходов «УОМО».


СВЧ технология   обеззараживания медицинских  и  других  отходов  при помощи СВЧ-печи имеет   важные преимущества перед традиционными методами:


Энергетические затраты на порядок ниже, чем при высокотемпературной обработке.


Обработку легко автоматизировать, контролировать и вести процесс в непрерывном режиме.


Экологическая безопасность метода (не используются и не образуются токсичные для человека и вредные для окружающей среды соединения).


Предназначена  для  обеззараживания  медицинских  отходов  классов Б (опасных) и В (чрезвычайно опасных) в местах их первичного образования или централизованно.


Обеззараженные   медицинские  и  другие  отходы,  в  зависимости  от   их   вида утилизируются.


Установка полностью соответствует СанПин 2.1.7.2790-10 по обращению с медицинскими отходами. 
Номинальная полезная мощность в рабочей камере, Вт, не менее: 1500
Ток, потребляемый установкой от сети в режиме 100% полезной мощности при номинальном напряжении сети, А, не более: 12
Количество уровней мощности, не менее: 2
Минимальная загрузка: 1 бак с увлаженными отходами, кг, не менее (в присутствии 2,0 л увлажнителя): 2
Максимальная загрузка: 2 бака с увлажненными отходами, кг, не более (в присутствии 1,5-2 л увлажнителя в каждом баке): 20
Объем рабочей камеры, л, не менее: 147
Потребляемая от сети мощность, Вт, не более: 2420±10%
Производительность, дм3/ч: до 60, но не более 25 кг/ч
Габаритные размеры (ДxШxВ), мм, не более: 1200x535x565
Масса установки без упаковки, нетто, кг, не более: 55 
Камера для вертикального электрофореза Mini-PROTEAN Tetra Cell на 4 геля 
15.jpg

Проведение анализа по разделению фрагментов белков и нуклеиновых кислот в полиакриламидном геле.


Генотипирование полиморфных вариантов генов, ассоциированных с разными патологиями. 

Количество гелей 1-4

Размер короткого стекла, см 10,1 х 7,3

Размер спейсерного стекла, см 10,1 х 8,2

Размер готового геля, см 8,3 х 7,3

Размер геля, приготовленного самостоятельно, см  8,3 х 6,8

Верхний объем буфера для 2 гелей, мл 160

Верхний объем буфера для 4 гелей, мл 320

Нижний объем буфера для 2 гелей, мл 550

Нижний объем буфера для 4 гелей, мл 680

Среднее время постановки SDS-PAGE электрофореза, мин 45 
Камера для горизонтального электрофореза "SE-2" 
16.jpg
Проведение анализа по разделению фрагментов и нуклеиновых кислот в полиакриламидном геле.

Генотипирование полиморфных вариантов генов, ассоциированных с разными патологиями в кардиологии, эндокринологии, онкологии и т.д. 

Габаритные размеры: 334x196x100 мм.
Вес: 700 г.
Рабочий объём буфера: 500 млн.
Размер геля: 170 x 120 мм.
Конструкция гелевых рамок позволяет устанавливать от 1 до 5 гребенок на гель.
Максимальный ток: 150 мА.
Максимальное напряжение: 250 В.
Максимальная допустимая мощность не более 20 Вт. 
Система MagPix для одновременного мультиплексного определения для 50 биоаналитов 
17.jpg.png
Система MagPix предназначена для клинических лабораторий: качественные и количественные исследования нуклеиновых кислот и белков – до 50 аналитов в одном образце. Компактная система с чувствительной CCD камерой минимизирует трудовые затраты, сокращает время анализа и экономит расходные материалы.  Количество анализируемых маркеров: 50
Оптическая схема: LED/CCD камера 2 светодиода: 525 нм и 635 нм
Динамический диапазон: 3,5 порядка


Сотрудники

Лаборатория геномики, протеомики и метаболомики 
1.   Коломечук Сергей Николаевич Заведующий лабораторией 8 (3452) 69-09-54 
kolomeychuksn@tyumsmu.ru
  
2. Межакова Марина Сергеевна Младший научный сотрудник
maslovamu@tyumsmu.ru
3.  Воронин Кирилл Андреевич Младший научный сотрудник

voroninka@tyumsmu.ru
4. Маслова Наталья Владимировна Лаборант



Контакты

Адрес: 625023, Тюменская область, г. Тюмень, ул. Одесская, 54, главный корпус, кабинет 744
Тел. 8 (3452) 69-09-54

E-mail:

Используя наш сайт вы даете нам согласие на использование файлов cookie-файлы на вашем устройстве в соответствии с нашей Политикой конфиденциальности. Если собранная информация содержит персональные данные мы будем обрабатывать ее в соответствии с Политикой персональных данных.