Размер шрифта:
- A
- A
- A
Цветовая схема:
- A
- A
- A
Тюменский государственный медицинский университет
Лаборатория геномики, протеомики, метаболомики
Лаборатория «Геномики, протеомики и метаболомики»:
- Выделение и хранение ДНК
- Фармогенетические исследования
- Исследования по определению предрасположенности к наследственным мульти факториальным заболеваниям различными методами: ПЦР-ПДРФ, ПЦР в реальном времени, секвенирование по Сэнгеру
- Разработка и внедрение методов диагностики десинхроноза на биохимическом уровне
- Поиск молекулярно-генетических причин заболеваний с наследственной этиологией
- Разработка и внедрение молекулярно-генетических методов диагностики наследственных, мульти факториальных заболеваний
- Биохимические исследования (определение уровня гормонов в плазме крови, определение концентраций низкомолекулярных соединений в биологических жидкостях организма)
Направления исследований:
- Анализ молекулярных путей адаптации организма человека и использование неинвазивных методов для повышения качества жизни населения Арктики. Лаборатория занимается поиском биомаркеров, позволяющих оценить уровень адаптации человека в условиях Арктики (вахтовых работников, военнослужащих и т.п.). Комбинирование методов темометри, актиметрии, геномики, протеомного анализа и биохимического анализа позволяет использовать получаемые экспериментальные данные для создания диагностических систем нового поколения для скрининга и профилактики хронических неинфекционных заболеваний детей и взрослых.
- Проведение исследований в рамках проекта «Внедрение антропоцентрического освещения в домах и на рабочих местах жителей Арктики и субарктики для улучшения здоровья, сна и работоспособности «Свет Арктики» («LightArctic»).
| Наименование | Функции прибора | Технические характеристики |
Устройство секвенирования ДНК "Нанофор"  |
Генетический анализатор Нанофор-05 – первый 8-капиллярный секвенатор (секвенирование по сэнгеру) российского производства. Основные приложения прибора – секвенирование de novo и ресеквенирование, фрагментный анализ: микросателлитный анализ, LOH, AFLP, исследование однонуклеотидных полиморфизмов (snp).
Применение:
Идентификация микроорганизмов, секвенирование плазмид для проверки правильности введения ДНК в вектор, проверка вариантов, обнаруженных с помощью NGS, подтверждение редактирования генома, проверка подлинности клеточных линий, генотипирование snp, mlpa, анализ микросателлитных маркеров. Идентификация микроорганизмов, секвенирование плазмид для проверки правильности введения днк в вектор, проверка вариантов, обнаруженных с помощью ngs, подтверждение редактирования генома, проверка подлинности клеточных линий, генотипирование snp, mlpa, анализ микросателлитных маркеров. |
Количество капилляров: 8 Напряжение, проводие к капилляром: 0,5 ÷ 20 (±0,03%) кВ |
Термоциклер для амплификации нуклеиновых кислот HK1000 в комплекте с модулем реакционным оптическим C1000 Touch Thermal Cycler  |
Амплификатор в реальном времени CFX96 touch с термоблоком 96 х 0.2 мл: 6 каналов детекции, температурный градиент, FRET, сенсорный дисплей, анализ кривых плавления HRM. Уровни экспрессии генов различаются на разных этапах заболевания и могут служить прогностическими маркерами тяжести болезни. Уровни экспрессии генов, таких как: • главный регулятор клеточного роста и пролиферации MTOR (mammalian target of rapamycin); • маркер аутофагии ulk1; ингибитора циклинзависимых киназ р21; • индикатор апоптозной активности каспазы 3; • провоспалительный цитокин фактора некроза опухоли α (TNFα) в крови больных ревматоидным артритом • генотипирование полиморфных вариантов генов, ассоциированных с разными патологиями. |
Термоциклер: C1000 Touch™ Входная мощность, Вт, не более: 850 Частота, Гц, одна фаза: 50–60 Цветной дисплей высокого разрешения, см: 12 х 9 Порты (USB A / USB B): 5/1 Предохранители — 2 (А/В/мм): 10/250/20 Встроенная память, протоколы: >1000 Размеры, см (дюймы): 33 х 46 х 20/13 х 18 х 8 Вес, кг/фунт: 23.10. Режимы контроля температуры: Рассчет и блокировка ПЦР лицензия: да Функции безопасности (защита паролем, необязательный вход в систему и безопасный режим): да Отчетность (экспортируемые журналы запусков и журналы системных ошибок): да Встроенное программное обеспечение, Windows CE 6.0: да Совместимость с ПК (Windows XP или выше): да Совместимость с периферийными устройствами USB (мышь, флэш-накопитель USB, считыватель штрих-кода): да Обновление ПЦР в реальном времени: да Мгновенная инкубация: да |
Система гель-документирования ChemiDoc XRS+ System  |
Chemidoc XRS+ − многофункциональная система гель-документирования для работы с широким спектром образцов. Программное обеспечение image lab позволяет решать основные задачи анализа и документирования гелей и мембран, и быстро получать точные и воспроизводимые результаты. Для фиксации нечетких, расплывчатых и бледных полос в систему chemidoc XRS+ встроена система охлаждения.
Решаемые задачи:
• Анализ одномерных и двумерных гелей • Колориметрический анализ вестерн- и дот-блотов • Флуоресценция • Детекция хемилюминесценции • Детекция нуклеиновых кислот • Денситометрия • Работа с гелями stain-free по безокрасочной технологии |
Операционная система: Windows XP SP3 Professional 32-bit Windows Vista SP2 Ultimate 32-bit Windows 7 Professional Mac OS X 10.5 or 10.6 Процессор: Core 2 Duo 2.09 GHz или выше Пространство на жестком диске: >100 ГБ (минимум 20 ГБ) Системная память: >1024 МБ Разрешение экрана: 1280 x 1024 или выш Порты для подсоединения инструментов: 1 свободный SB 2.0 порт Другой software: Microsoft Office 2000 or later (Windows) Office 2008 или iWork (Mac) |
Система для СВЧ-обеззараживания медицинских отходов УОМО-01/150-"О-ЦЕНТ"  |
Cистема для СВЧ-обезвреживания медицинских отходов «УОМО».
СВЧ технология обеззараживания медицинских и других отходов при помощи СВЧ-печи имеет важные преимущества перед традиционными методами:
Энергетические затраты на порядок ниже, чем при высокотемпературной обработке.
Обработку легко автоматизировать, контролировать и вести процесс в непрерывном режиме.
Экологическая безопасность метода (не используются и не образуются токсичные для человека и вредные для окружающей среды соединения).
Предназначена для обеззараживания медицинских отходов классов Б (опасных) и В (чрезвычайно опасных) в местах их первичного образования или централизованно.
Обеззараженные медицинские и другие отходы, в зависимости от их вида утилизируются.
|
Номинальная полезная мощность в рабочей камере, Вт, не менее: 1500 Ток, потребляемый установкой от сети в режиме 100% полезной мощности при номинальном напряжении сети, А, не более: 12 Количество уровней мощности, не менее: 2 Минимальная загрузка: 1 бак с увлаженными отходами, кг, не менее (в присутствии 2,0 л увлажнителя): 2 Максимальная загрузка: 2 бака с увлажненными отходами, кг, не более (в присутствии 1,5-2 л увлажнителя в каждом баке): 20 Объем рабочей камеры, л, не менее: 147 Потребляемая от сети мощность, Вт, не более: 2420±10% Производительность, дм3/ч: до 60, но не более 25 кг/ч Габаритные размеры (ДxШxВ), мм, не более: 1200x535x565 Масса установки без упаковки, нетто, кг, не более: 55 |
Камера для вертикального электрофореза Mini-PROTEAN Tetra Cell на 4 геля  |
Проведение анализа по разделению фрагментов белков и нуклеиновых кислот в полиакриламидном геле.
|
Количество гелей 1-4 Размер короткого стекла, см 10,1 х 7,3 Размер спейсерного стекла, см 10,1 х 8,2 Размер готового геля, см 8,3 х 7,3 Размер геля, приготовленного самостоятельно, см 8,3 х 6,8 Верхний объем буфера для 2 гелей, мл 160 Верхний объем буфера для 4 гелей, мл 320 Нижний объем буфера для 2 гелей, мл 550 Нижний объем буфера для 4 гелей, мл 680 Среднее время постановки SDS-PAGE электрофореза, мин 45 |
Камера для горизонтального электрофореза "SE-2"  |
Проведение анализа по разделению фрагментов и нуклеиновых кислот в полиакриламидном геле. Генотипирование полиморфных вариантов генов, ассоциированных с разными патологиями в кардиологии, эндокринологии, онкологии и т.д. |
Габаритные размеры: 334x196x100 мм. Вес: 700 г. Рабочий объём буфера: 500 млн. Размер геля: 170 x 120 мм. Конструкция гелевых рамок позволяет устанавливать от 1 до 5 гребенок на гель. Максимальный ток: 150 мА. Максимальное напряжение: 250 В. Максимальная допустимая мощность не более 20 Вт. |
Система MagPix для одновременного мультиплексного определения для 50 биоаналитов  |
Система MagPix предназначена для клинических лабораторий: качественные и количественные исследования нуклеиновых кислот и белков – до 50 аналитов в одном образце. Компактная система с чувствительной CCD камерой минимизирует трудовые затраты, сокращает время анализа и экономит расходные материалы. |
Количество анализируемых маркеров: 50 Оптическая схема: LED/CCD камера 2 светодиода: 525 нм и 635 нм Динамический диапазон: 3,5 порядка |
Сотрудники
| Лаборатория геномики, протеомики и метаболомики | |||
| 1. |
 Коломечук Сергей Николаевич |
Заведующий лабораторией |
8 (3452) 69-09-54 kolomeychuksn@tyumsmu.ru |
| 2. |
 Межакова Марина Сергеевна |
Младший научный сотрудник |
maslovamu@tyumsmu.ru |
| 3. |
 Воронин Кирилл Андреевич |
Младший научный сотрудник |
voroninka@tyumsmu.ru |
| 4. |
 Маслова Наталья Владимировна |
Лаборант |
|
Документы
Положение о Лаборатории геномики протеомики и метаболомики Размер файла: 626.22 Кбid: 110771
Контакты
Адрес:
625023, Тюменская область, г. Тюмень, ул. Одесская, 54, главный корпус, кабинет 744
Тел. 8 (3452) 69-09-54
E-mail: kolomeychuksn@tyumsmu.ru